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【成功经验影音分享】肿瘤单细胞定序关键第一步「单细胞实验前处理的选择方案」

Methods for Sample Preparation

and Single Cell Sequencing of Solid Tumors

In this engaging presentation at AACR 2018, Dr. Jill Herschleb, Associate Director at 10x Genomics, explains why methods matter in single-cell analyses of tumors. Herschleb describes the tumor dissociation workflow, offers best practices for processing tumor tissue and presents a case study where her team sequenced 84,042 single cells from nine tumors.

 

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(10x Genomics官方建议MACS品项)


 

单细胞分离的示范方案

 

  单细胞基因表达谱分析(Single Cell Gene Expression)能够从单一细胞的角度,研究复杂多型态细胞样本的基因表达动态,深入了解参与疾病发展过程中不同类型细胞之间的特定差异;如何制备特定的类型、活力高的单细胞,以及如何避免细胞死亡和裂解,获得最佳的单细胞品质,我们提供下列的指南与制备方案,有效协助与完成单细胞RNA定序(scRNA-seq)实验流程。
 

  1. 单细胞方案-细胞制备指南
    该细胞制备指南介绍了在制备大量细胞和有限细胞(细胞总数分别高于或低于100,000个)的悬浮液时,清洗、计数和浓缩细胞的最佳做法和通用方法,以便用于10x Genomics的单细胞方案。
    详细解决方案请点此连结
  2. 肿瘤样本解离指南-用于单细胞RNA定序
    该指南介绍了在处理肿瘤组织的单细胞悬浮液和神经组织时,裂解细胞、清洗细胞、去除碎片和浓缩细胞核的最佳做法和通用方法,以便用于10x Genomics的单细胞方案。
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  3. 从培养细胞株中制备单细胞悬浮液-用于单细胞RNA定序 
    该指南概述了如何从培养细胞株制备单细胞悬浮液,以便用于10x Genomics的单细胞方案。

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  4. 从单细胞悬浮液中去除死细胞-用于单细胞RNA定序
    该指南概述了减少单细胞悬浮液中死细胞比例的最佳做法。

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  5. 分离细胞核-用于单细胞RNA定序
    该指南介绍了在制备单细胞悬浮液和神经组织时,裂解细胞、清洗细胞、去除碎片和浓缩细胞核的最佳做法和通用方法,以便用于10x Genomics的单细胞方案。
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  6. 从解离组织中富集CD3+T细胞-用于单细胞RNA定序和免疫组资料库分析
    该指南概述了从解离肿瘤组织中富集CD3+T细胞的最佳做法,以便用于10x Genomics的单细胞方案。
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  7. 完整单细胞前处理解决方案专页,请点此连结
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