【成功經驗影音分享】腫瘤單細胞定序關鍵第一步「單細胞實驗前處理的選擇方案」

Methods for Sample Preparation

and Single Cell Sequencing of Solid Tumors

In this engaging presentation at AACR 2018, Dr. Jill Herschleb, Associate Director at 10x Genomics, explains why methods matter in single-cell analyses of tumors. Herschleb describes the tumor dissociation workflow, offers best practices for processing tumor tissue and presents a case study where her team sequenced 84,042 single cells from nine tumors.

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(10x Genomics官方建議MACS品項)

單細胞分離的示範方案

　　單細胞基因表達譜分析(Single Cell Gene Expression)能夠從單一細胞的角度，研究複雜多型態細胞樣本的基因表達動態，深入了解參與疾病發展過程中不同類型細胞之間的特定差異；如何製備特定的類型、活力高的單細胞，以及如何避免細胞死亡和裂解，獲得最佳的單細胞品質，我們提供下列的指南與製備方案，有效協助與完成單細胞RNA定序(scRNA-seq)實驗流程。
 

1. 單細胞方案-細胞製備指南
   該細胞製備指南介紹了在製備大量細胞和有限細胞(細胞總數分別高於或低於100,000個)的懸浮液時，清洗、計數和濃縮細胞的最佳做法和通用方法，以便用於10x Genomics的單細胞方案。
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2. 腫瘤樣本解離指南-用於單細胞RNA定序
   該指南介紹了在處理腫瘤組織的單細胞懸浮液和神經組織時，裂解細胞、清洗細胞、去除碎片和濃縮細胞核的最佳做法和通用方法，以便用於10x Genomics的單細胞方案。
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3. 從培養細胞株中製備單細胞懸浮液-用於單細胞RNA定序 
   該指南概述了如何從培養細胞株製備單細胞懸浮液，以便用於10x Genomics的單細胞方案。
   
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4. 從單細胞懸浮液中去除死細胞-用於單細胞RNA定序
   該指南概述了減少單細胞懸浮液中死細胞比例的最佳做法。
   
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5. 分離細胞核-用於單細胞RNA定序
   該指南介紹了在製備單細胞懸浮液和神經組織時，裂解細胞、清洗細胞、去除碎片和濃縮細胞核的最佳做法和通用方法，以便用於10x Genomics的單細胞方案。
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6. 從解離組織中富集CD3⁺T細胞-用於單細胞RNA定序和免疫組資料庫分析
   該指南概述了從解離腫瘤組織中富集CD3⁺T細胞的最佳做法，以便用於10x Genomics的單細胞方案。
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7. 完整單細胞前處理解決方案專頁，請點此連結